Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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