Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXE3Q13461 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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