Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 PSG9-209ENST00000621109 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 EPN2-204ENST00000395620 3860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC020658.3-201ENST00000568093 4028 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TRIM6-212ENST00000621176 3005 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 CDH13-202ENST00000428848 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC009044.1-201ENST00000624577 1798 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CST11-201ENST00000377007 461 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RN7SL496P-201ENST00000470372 290 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC018695.1-201ENST00000484096 664 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC127029.1-201ENST00000560822 237 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC006130.1-201ENST00000589365 555 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 MMP13-202ENST00000340273 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 ATF7IP-221ENST00000543189 4887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC244505.1-201ENST00000502642 307 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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MKRN4PQ13434 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC087269.1-201ENST00000522213 666 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 IGKV2D-14-201ENST00000522473 355 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN4PQ13434 SLC25A3P2-201ENST00000547720 880 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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