Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SP140Q13342 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms