Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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