Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CBX1P83916 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CBX1P83916 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CBX1P83916 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CBX1P83916 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CBX1P83916 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBX1P83916 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBX1P83916 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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