Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 RN7SL14P-201ENST00000579715 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2P78314 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms