Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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HOXD10P28358 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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