Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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