Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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CNTN3Q9P232 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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CNTN3Q9P232 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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CNTN3Q9P232 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNTN3Q9P232 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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