Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TM6SF1Q9BZW5 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TM6SF1Q9BZW5 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TM6SF1Q9BZW5 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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