Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 IL37-201ENST00000263326 772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 IL37-202ENST00000311328 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC11B-201ENST00000382776 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MRPS18BP1-201ENST00000414228 192 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FTLP2-201ENST00000431458 528 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP001476.2-201ENST00000435738 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP45-201ENST00000452090 349 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NDUFB11P1-201ENST00000455818 465 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC105265.1-201ENST00000479379 179 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DMKN-253ENST00000488892 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SL167P-201ENST00000498381 302 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TAGLN2P1-201ENST00000524097 587 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000879.1-201ENST00000526174 976 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC087521.3-201ENST00000528226 553 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GLTPP1-201ENST00000528859 622 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR7E11P-201ENST00000532901 952 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL442663.4-201ENST00000555304 289 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TEX51-207ENST00000568484 731 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC005552.1-201ENST00000577556 662 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SSH2-209ENST00000579954 428 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 C5orf67-202ENST00000611197 354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 BCAS3-233ENST00000626960 227 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms