Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CTF1Q16619 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CTF1Q16619 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CTF1Q16619 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CTF1Q16619 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CTF1Q16619 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CTF1Q16619 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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CTF1Q16619 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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