Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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VPS72Q15906 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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VPS72Q15906 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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VPS72Q15906 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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VPS72Q15906 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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