Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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VAMP3Q15836 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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VAMP3Q15836 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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