Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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