Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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