Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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