Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TTF2Q9UNY4 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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