Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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