Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 HDAC9-212ENST00000432645 3099 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC000068.3-201ENST00000607934 427 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
C4orf17Q53FE4 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms