Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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