Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ZBTB43-201ENST00000373457 5695 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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LAMA3Q16787 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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LAMA3Q16787 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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