Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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