Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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