Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ASB8-205ENST00000536549 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ADAM3A-206ENST00000484602 1046 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 MIR7150-201ENST00000614393 94 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 IL17RD-202ENST00000320057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 WISP3-204ENST00000368666 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 LINC00558-201ENST00000569422 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AC016582.1-201ENST00000592640 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN4PQ13434 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AL137145.2-201ENST00000399868 3086 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DAZ4-203ENST00000382432 2405 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DAZ2-205ENST00000382433 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 BTK-202ENST00000372880 2248 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 AL583836.1-201ENST00000464755 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN4PQ13434 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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