Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms