Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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