Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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