Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SLC25A14P1-201ENST00000502867 901 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms