Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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