Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SRSF4Q08170 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms