Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP35Q9P2H5 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms