Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC88CQ9P219 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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