Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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SH3BP4Q9P0V3 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SH3BP4Q9P0V3 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SH3BP4Q9P0V3 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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