Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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