Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB6CQ53S08 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms