Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACKR1Q16570 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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