Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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