Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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