Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SS18Q15532 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SS18Q15532 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SS18Q15532 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SS18Q15532 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SS18Q15532 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SS18Q15532 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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