Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SYCP1Q15431 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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