Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms