Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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CUL3Q13618 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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CUL3Q13618 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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CUL3Q13618 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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