Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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