Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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ITGB3BPQ13352 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ITGB3BPQ13352 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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ITGB3BPQ13352 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ITGB3BPQ13352 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ITGB3BPQ13352 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ITGB3BPQ13352 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ITGB3BPQ13352 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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