Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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