Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms