Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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