Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SYNMO15061 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SYNMO15061 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SYNMO15061 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SYNMO15061 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SYNMO15061 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SYNMO15061 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
SYNMO15061 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SYNMO15061 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNMO15061 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms